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          【允英學術】碩果累累 | 允英醫療攜手徐州醫科大學附屬醫院發現胸腺上皮腫瘤新的預后不良標志物
          發布時間: 2023-2-1 8:33:46

              

              近日,允英醫療攜手徐州醫科大學附屬醫院,借助于允英自主研發的高效DNA提取技術DNAplus?和精準液相雜交捕獲技術AllNGS?打造的實體瘤全程管理產品Panel-315,繪制了中國人群胸腺上皮腫瘤的分子特征圖譜,并首次提出NFKBIA基因是胸腺上皮瘤患者不良預后的重要標志及潛在治療藥物靶點。相關研究成果“Genomic characterization of thymic epithelial tumors reveals critical genes underlying tumorigenesis and poor prognosis”發表于SCI雜志Clinical Genetics (IF=4.296,DOI: 10.1111/cge.14285)。本文通訊作者為徐醫附院胸外科譚勝主任,允英醫療CEO張道允博士及研發總監鞏子英博士擔任共同通訊作者1。

              本研究隊列由47名患者構成,總計39例胸腺瘤和8例胸腺癌患者被納入研究。入組患者均提供了經福爾馬林固定的石蠟包埋組織樣本,并使用允英醫療實體瘤全程管理產品Panel-315進行了腫瘤發生、發展及用藥相關的315個基因的全外顯子及部分內含子靶向測序。數據在過濾胚系突變后,共報告了114個基因上的178個突變。最常見的突變類型是錯義突變、移碼突變和無義突變,最常見的突變基因是KMT2C(13%)、SPTA1(11%)、TET2(9%)、KDM6A(9%)和ATM(9%)。值得注意的是,本研究隊列中所有患者均未表現出微衛星高度不穩定特征,且存在極高比例的C > T轉變SNV(55%),這可能是胸腺上皮瘤患者的潛在特征之一。
              有趣的是,本研究還發現胸腺癌患者突變基因數(7.3)明顯高于A/AB亞型(3.4)和B1-3亞型(2.7)的胸腺瘤患者,且不同亞型的高頻突變基因譜存在較大差異。此外,在腫瘤突變負荷(TMB)方面,不僅胸腺癌患者TMB明顯高于胸腺瘤患者,男性患者TMB也顯著高于女性。
              為了進一步評估檢出突變的臨床意義,本研究在OncoKB等公共數據庫中進行了對比檢索,結果發現了24個基因中的32個驅動突變,其中最常見的是僅在隊列TC亞型中觀察到的NFKBIA和TP53基因的功能缺失突變。同時,本研究發現胸腺上皮瘤患者中NFKBIA和TP53的表達量相對于癌旁組織明顯升高,且不同亞型間表達量存在異質性。值得注意的是,TC亞型中NFKBIA的表達量明顯高于其他亞型。

              最后,本研究探討了這一分子差異對胸腺上皮瘤患者預后的指導意義。結果發現,高TMB患者、高NFKBIA表達患者以及TP53突變攜帶者的5年生存率較差,是胸腺上皮瘤患者的不良預后因素。

              綜上,本研究解析了不同亞型的胸腺上皮瘤患者基因組特征圖譜,同時基于不同亞型分子特征挖掘了一系列生物標志物并開發了新型臨床分層管理策略,并可應用于胸腺上皮瘤患者預后評估,為患者提供精準醫療指導。


          參考文獻:

          1. Tan S, Chen J, Wang Z, et al. Genomic characterization of thymic epithelial tumors reveals critical genes underlying tumorigenesis and poor prognosis. Clin Genet. 2022;doi:10.1111/cge.14285

              允英醫療以長三角區域為中心,輻射全中國,公司致力于打造癌癥精準診療的新型生態圈,綜合運用基因突變檢測、基因甲基化檢測、基因編輯重組等生物科技的前沿技術,全方位提供從癌癥早期精準篩查、癌癥靶向用藥檢測、癌癥治療藥物研發一體化的腫瘤精準醫學解決方案。目前在上海、浙江及青海共設有三家實驗室。
              允英醫療成立至今,順利通過由國家衛健委臨檢中心、國家病理質控中心、美國病理學會等機構組織的室間質評。檢驗能力獲得了美國病理學會PT認證、國際ISO13485認證,部分試劑盒通過歐盟CE認證,獲得國家藥品監督管理局(NMPA)注冊批準。目前允英已累計為近三十萬例腫瘤患者提供精準檢測服務,為國內腫瘤精準醫療領域開拓者。同時允英秉承“嚴謹、高效”的理念,堅守分子診斷技術創新與應用探索,為腫瘤精準醫療與伴隨診斷領域的茁壯發展貢獻力量。